氢氘交换质谱技术 (HDX-MS) 是一种强大而重要的工具,可以用于获取蛋白质动态结构解析、蛋白质-蛋白质或蛋白质-配体相互作用位点、变构效应、内在紊乱和翻译后修饰 (PTM) 诱导的构象变化等信息。
氢氘交换质谱技术原理:将蛋白浸入重水(D2O)溶液中,蛋白的氢原子将于重水的氘原子发生交换,而且蛋白质表面与重水密切接触的氢比位于蛋白质内部的或参与氢键形成的氢的交换速率快,进而通过质谱检测确定蛋白质不同序列片段的氢氘交换速率,从而得出蛋白质空间结构信息。
由于蛋白质的高级结构和构象动力学与生物药剂的功效密切相关,因此在药物发现和开发过程中,了解蛋白质的高级结构、构象变化以及相互作用非常必要。
百蓁生物提供全套的 HDX-MS 服务体系,以发现各种类型样品,例如单克隆抗体 (mAb)、抗体-药物偶联物 (ADC)、病毒衣壳、生物仿制药等蛋白质构象、动力学、相互作用的信息,可用于生物仿制药评价、治疗性蛋白质QC、药理学研究等应用领域。
1. 百蓁实验平台的优势:
a. 低温精控全自动化样品前处理系统,低回交率,高重现性,高定量准确性;实现秒到小时时间尺度的蛋白质高级结构精确表征;
b. 搭载Thermo Orbitrap超高分辨三合一质谱仪,Top-Down、Middle-Down、Bottom-Up三种分析模式,CID、HCD、ETD多种碎裂方式,提升质谱采集数据广度与覆盖度;
c. 自主PEAKS软件平台深度解析质谱数据,获取更高深度和准确度肽段信息;
2. HDX-MS 方法的优势:
a. 蛋白质在溶液中处于天然状态而非晶体状态,直接鉴定蛋白复合体构象
b. 能够进行蛋白质结构动态变化的研究,包括变化中的活性位点及表位;
c. 质谱检测灵敏度高,蛋白质样品用量少(微克级);对样品纯度要求低;质谱分析速度快,极大缩短实验周期。
3. 数据分析与结果呈现的优势:
a. HDExaminer定量分析结合人工校准,精确分析氘掺入量变化趋势,可完成抗体表位分析、抗体批次间差异效应分析、蛋白质相互作用分析、蛋白质-配体相互作用分析、蛋白质动态结构变化分析等多种需求。
b. 多种可视化结果呈现方式,并可以通过pyMOL或Chimera渲染到蛋白质晶体结构,简洁形象。
近二十年来氢氘交换质谱技术不断发展,它正在成为结构生物学家及生物药物研发的重要手段。HDX-MS技术流程:样品制备、交换反应、终止反应、样品酶解、LC-MS检测、数据解析。
山东大学,上海科技大学,中科院生化细胞所,华中农业大学,天津大学,复旦大学附属中山医院,中国科学院广州生物医药与健康研究院,中科院上海有机化学研究所等